PathogenoTM病原体靶向测序从患者的肺泡灌洗液样本中检测出新生隐球菌

65岁的女性患者，因“间断咳嗽咳痰2月余”入院。患者4个月前体检时行胸部CT示右肺上叶结节，因无明显症状，未予以重视，未予以治疗。2月前开始出现阵发性咳嗽，咳少许黄痰，晨起明显，伴盗汗，自觉有发热无乏力胸闷。入院后行T-SPOT检测结果为阴性。灌洗液培养+药敏检测结果为阴性，灌洗液真菌+药敏，无念珠菌生长。灌洗液涂片偶见革兰氏阳性菌。灌洗液NGS提示肺炎链球菌、流血嗜血杆菌、金黄色葡萄球菌。抗感染治疗14天后病情好转后出院。半月前复查胸部CT右肺上叶尖段斑片影，呈卫星灶。不能排除“肺结核”可能，门诊以“结核待查”入院。入院后先后予以头孢米诺、莫西沙星抗感染治疗以及溴己星化痰治疗。

辅助检查：

白细胞：3.24*10^9/L，淋巴细胞绝对数：CD4/CD45+52.0,CD8/CD45+14.0CD8+T细胞个/ul；血沉、凝血功能检测、肾功能、粪便常规、隐球菌抗原定性、肺癌标志物+甲状腺功能五项常、结核抗体全套、CEA、心肌酶谱全套等均未见明显异常。灌洗液检测和痰结核分枝杆菌涂片均为阴性。灌洗液培养和药敏未见明显异常。

临床考虑：1.NTM2.肺癌3.隐球菌感染

PathogenoTM病原体靶向测序协助医生锁定了感染真凶，为患者下一步的治疗提供了方向。

新生隐球菌

隐球菌属包括17个种和18个变种，其中仅新生隐球菌及其变种具有致病性，主要侵犯中枢神经系统。新生隐球菌系环境腐生菌，广泛生存于土壤和鸽粪中。正常人常处于新生隐球菌污染的环境中，但发病者极少。当机体抵抗力降低时，才易侵入人体而致病。由于肿瘤及化疗药物的使用、艾滋病的流行、移植术后免疫抑制药物的使用等原因，新生隐球菌的发病率越来越高，在国外已成为艾滋病患者常见的并发症之一，也是导致患者死亡的重要原因。在我国新生隐球菌的发病率也呈逐年增加的趋势。

致病性

新生隐球菌的荚膜多糖是其主要的致病物质，可能与它能抑制机体免疫功能及增加免疫耐受性有关。动物试验证明，无荚膜的突变株缺乏对小鼠的致病力，恢复产生荚膜能力后则可重获致病力。荚膜多糖能抑制中性粒细胞的吞噬作用，削弱T细胞对其产生免疫应答等。

新生隐球菌一般为外源性感染，大量存在于鸟、鸽粪中。鸽子是重要传染源。主要的入侵途径是呼吸道，常引起肺部感染。新生隐球菌也可见于人体正常微生物群中，当机体免疫力低下时可发生内源性感染，如易发于白血病，艾滋病及糖尿病患者。新生隐球菌也可以从肺部经血行播散至其他部位，最易侵犯中枢神经系统，主要引起脑膜的亚急性和慢性感染，死亡率高，尚可播散至皮肤、黏膜、骨和内脏器官等。